新的数字工具可以改变我们看待细胞的方式
能够观察和跟踪细胞随时间变化和发育的方式是科学和医学研究的重要组成部分。
细胞的延时研究可以向我们展示细胞在某些环境中如何突变或它们对外部影响的反应,例如医疗。这些信息可以揭示疾病如何传播以及为什么一些患者的细胞对化疗等治疗没有反应。
跟踪特定细胞特征的发展是一个困难的过程,然而,约克大学生物和数学系的科学家现在已经创建了一个免费的数字工具,可以提供帮助。
该软件包名为CellPhe,是同类软件包中的第一个,因为它可以在延时研究中提取细胞的一系列特征,并根据细胞的行为和内部结构表征细胞。该软件包还会自动消除单元格跟踪中的错误,以提高数据质量。
在3月<>日发表在《自然通讯》上的一项研究中,CellPhe正确识别了两组不同的乳腺癌细胞 - 一组用化疗药物治疗,另一组没有。比较两组,CellPhe还能够识别出治疗细胞的潜在耐药亚群。
这样的数据对于了解乳腺癌和设计其治疗方法尤为重要,因为化学耐药性通常会导致乳腺癌患者的复发。
CellPhe还可以在药物筛选和疾病预后预测等过程中有进一步的实际应用。
生物学系的劳拉·威金斯(Laura Wiggins)说:“能够以如此前所未有的细节量化细胞行为,这是非常令人兴奋的。
“为了使CellPhe用户友好并适应新应用程序,我们付出了很多努力,因此我们期待看到社区如何使用我们的工具包。
我们预计CellPhe将在我们理解细胞药物反应以及细胞通过信号传导和直接接触相互通信的方式中发挥关键作用。
CellPhe可在线免费获得,可以在任何操作系统上运行,并配有手册和说明视频。
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